Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3558Q5FWC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3558Q5FWC9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3558Q5FWC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3558Q5FWC9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3558Q5FWC9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3558Q5FWC9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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