Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim80Q3V061 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim80Q3V061 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Trim80Q3V061 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trim80Q3V061 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trim80Q3V061 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trim80Q3V061 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trim80Q3V061 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trim80Q3V061 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trim80Q3V061 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Trim80Q3V061 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Trim80Q3V061 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms