Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pip4p1Q3TWL2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pip4p1Q3TWL2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pip4p1Q3TWL2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pip4p1Q3TWL2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pip4p1Q3TWL2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pip4p1Q3TWL2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pip4p1Q3TWL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pip4p1Q3TWL2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4p1Q3TWL2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4p1Q3TWL2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pip4p1Q3TWL2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms