Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCN1Q15293 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCN1Q15293 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCN1Q15293 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCN1Q15293 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN1Q15293 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCN1Q15293 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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RCN1Q15293 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCN1Q15293 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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