Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd3Q14AI6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd3Q14AI6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd3Q14AI6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpusd3Q14AI6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpusd3Q14AI6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpusd3Q14AI6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd3Q14AI6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd3Q14AI6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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