Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 RPL4BYDR012W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
PRP46Q12417 RPL4AYBR031W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
PRP46Q12417 FRE6YLL051C 2139 nt9.09□□□□□ -0.95
PRP46Q12417 YML089CYML089C 369 nt9.09□□□□□ -0.95
PRP46Q12417 RTN2YDL204W 1182 nt9.07□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 RBG2YGR173W 1107 nt9.07□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 RPS14BYJL191W 417 nt9.07□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 TOM6YOR045W 186 nt9.07□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 HIP1YGR191W 1812 nt9.05□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 PRO1YDR300C 1287 nt9.05□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 CLB6YGR109C 1143 nt9.05□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 UTH1YKR042W 1098 nt9.04□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 YMR226CYMR226C 804 nt9.04□□□□□ -0.96
PRP46Q12417 TIF6YPR016C 738 nt9.02□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 PEX2YJL210W 816 nt9.01□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 YKR005CYKR005C 1578 nt8.99□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 HSP60YLR259C 1719 nt8.99□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 ATG15YCR068W 1563 nt8.98□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 MET28YIR017C 564 nt8.97□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 NRT1YOR071C 1797 nt8.96□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 GAP1YKR039W 1809 nt8.96□□□□□ -0.97
PRP46Q12417 PLB1YMR008C 1995 nt8.96□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 YGR259CYGR259C 441 nt8.96□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 RAD23YEL037C 1197 nt8.95□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 TSC10YBR265W 963 nt8.95□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 YLR111WYLR111W 333 nt8.93□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 PRP4YPR178W 1398 nt8.93□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 SDH5YOL071W 489 nt8.91□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 MCH5YOR306C 1566 nt8.9□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 YGR012WYGR012W 1182 nt8.9□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 FIT3YOR383C 615 nt8.9□□□□□ -0.98
PRP46Q12417 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.89□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 YLR279WYLR279W 390 nt8.88□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 DIF1YLR437C 402 nt8.88□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 DPS1YLL018C 1674 nt8.88□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 CAB5YDR196C 726 nt8.87□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 UTR1YJR049C 1593 nt8.86□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 RIB3YDR487C 627 nt8.85□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 BMT6YLR063W 1098 nt8.85□□□□□ -0.99
PRP46Q12417 IRC24YIR036C 792 nt8.83□□□□□ -1
PRP46Q12417 YAR028WYAR028W 705 nt8.83□□□□□ -1
PRP46Q12417 SAM1YLR180W 1149 nt8.83□□□□□ -1
PRP46Q12417 MSB4YOL112W 1479 nt8.82□□□□□ -1
PRP46Q12417 ALG12YNR030W 1656 nt8.79□□□□□ -1
PRP46Q12417 MTG2YHR168W 1557 nt8.78□□□□□ -1
PRP46Q12417 ALP1YNL270C 1722 nt8.77□□□□□ -1
PRP46Q12417 AAC1YMR056C 930 nt8.76□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 ZTA1YBR046C 1005 nt8.76□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 PRM5YIL117C 957 nt8.75□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 SNF1YDR477W 1902 nt8.74□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 SAM35YHR083W 990 nt8.74□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.74□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 AKR2YOR034C 2250 nt8.74□□□□□ -1.01
PRP46Q12417 SED1YDR077W 1017 nt8.68□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 GND1YHR183W 1470 nt8.68□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 FCY21YER060W 1587 nt8.68□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 ALD4YOR374W 1560 nt8.65□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 YPI1YFR003C 468 nt8.65□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 DBP1YPL119C 1854 nt8.65□□□□□ -1.02
PRP46Q12417 APT2YDR441C 546 nt8.64□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 LOT5YKL183W 921 nt8.64□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 ADH1YOL086C 1047 nt8.63□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 SSN3YPL042C 1668 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 HIF1YLL022C 1158 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 LIP1YMR298W 453 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.62□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YNR029CYNR029C 1290 nt8.61□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 BSP1YPR171W 1731 nt8.6□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 BIO5YNR056C 1686 nt8.6□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 FUN14YAL008W 597 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YJL195CYJL195C 702 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 SMM1YNR015W 1155 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YPL251WYPL251W 303 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 YBL086CYBL086C 1401 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 UGA4YDL210W 1716 nt8.59□□□□□ -1.03
PRP46Q12417 HXT1YHR094C 1713 nt8.57□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 LEU9YOR108W 1815 nt8.57□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 RAD51YER095W 1203 nt8.57□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 YLR349WYLR349W 507 nt8.56□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 HXT12YIL170W 1374 nt8.55□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 NAR1YNL240C 1476 nt8.54□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 PRY1YJL079C 900 nt8.54□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 STE4YOR212W 1272 nt8.54□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.53□□□□□ -1.04
PRP46Q12417 BRR1YPR057W 1026 nt8.51□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 UFO1YML088W 2007 nt8.48□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 YEL008WYEL008W 381 nt8.48□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 SHY1YGR112W 1170 nt8.48□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 MEP3YPR138C 1470 nt8.48□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 RIB2YOL066C 1776 nt8.46□□□□□ -1.05
PRP46Q12417 CSM1YCR086W 573 nt8.46□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 TOA2YKL058W 369 nt8.45□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 YMR103CYMR103C 363 nt8.45□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 PBP1YGR178C 2169 nt8.44□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.44□□□□□ -1.06
PRP46Q12417 ZRT3YKL175W 1512 nt8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms