Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YML089CYML089C 369 nt8.84□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 NDI1YML120C 1542 nt8.82□□□□□ -1
NIP7Q08962 PRO1YDR300C 1287 nt8.82□□□□□ -1
NIP7Q08962 POM34YLR018C 900 nt8.82□□□□□ -1
NIP7Q08962 AAC1YMR056C 930 nt8.81□□□□□ -1
NIP7Q08962 CLB6YGR109C 1143 nt8.8□□□□□ -1
NIP7Q08962 SBA1YKL117W 651 nt8.8□□□□□ -1
NIP7Q08962 TOM6YOR045W 186 nt8.8□□□□□ -1
NIP7Q08962 ATG15YCR068W 1563 nt8.8□□□□□ -1
NIP7Q08962 PLB1YMR008C 1995 nt8.8□□□□□ -1
NIP7Q08962 RPL4BYDR012W 1089 nt8.79□□□□□ -1
NIP7Q08962 RPL4AYBR031W 1089 nt8.79□□□□□ -1
NIP7Q08962 IRC24YIR036C 792 nt8.78□□□□□ -1
NIP7Q08962 GAP1YKR039W 1809 nt8.77□□□□□ -1
NIP7Q08962 PEX2YJL210W 816 nt8.76□□□□□ -1.01
NIP7Q08962 UTH1YKR042W 1098 nt8.75□□□□□ -1.01
NIP7Q08962 GLR1YPL091W 1452 nt8.75□□□□□ -1.01
NIP7Q08962 HIP1YGR191W 1812 nt8.73□□□□□ -1.01
NIP7Q08962 NRT1YOR071C 1797 nt8.71□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 MET28YIR017C 564 nt8.7□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 TIF6YPR016C 738 nt8.7□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 SAM35YHR083W 990 nt8.69□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 RPS14BYJL191W 417 nt8.69□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 UTR1YJR049C 1593 nt8.67□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 SDH5YOL071W 489 nt8.67□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 SNF1YDR477W 1902 nt8.66□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 YMR244WYMR244W 1068 nt8.65□□□□□ -1.02
NIP7Q08962 UME6YDR207C 2511 nt8.63□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 FIT3YOR383C 615 nt8.63□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 TSC10YBR265W 963 nt8.63□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 PRM5YIL117C 957 nt8.62□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 YLR111WYLR111W 333 nt8.62□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 DIF1YLR437C 402 nt8.62□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 ALG12YNR030W 1656 nt8.62□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 YAR028WYAR028W 705 nt8.6□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 YMR226CYMR226C 804 nt8.59□□□□□ -1.03
NIP7Q08962 ALD4YOR374W 1560 nt8.57□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 BIO5YNR056C 1686 nt8.57□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 RAD23YEL037C 1197 nt8.55□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 YGR012WYGR012W 1182 nt8.55□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 ALP1YNL270C 1722 nt8.54□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 RBG2YGR173W 1107 nt8.53□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 AKR2YOR034C 2250 nt8.52□□□□□ -1.04
NIP7Q08962 HIF1YLL022C 1158 nt8.51□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 YLR279WYLR279W 390 nt8.51□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 MTG2YHR168W 1557 nt8.51□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 SED1YDR077W 1017 nt8.5□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 LIP1YMR298W 453 nt8.47□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 ZTA1YBR046C 1005 nt8.47□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 HXT1YHR094C 1713 nt8.46□□□□□ -1.05
NIP7Q08962 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.46□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 MSB4YOL112W 1479 nt8.45□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 RIB3YDR487C 627 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.44□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 DBP1YPL119C 1854 nt8.43□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 NAR1YNL240C 1476 nt8.42□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 SAM1YLR180W 1149 nt8.41□□□□□ -1.06
NIP7Q08962 CYT2YKL087C 675 nt8.39□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.39□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 YBL086CYBL086C 1401 nt8.37□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 PBP1YGR178C 2169 nt8.37□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 ZRT3YKL175W 1512 nt8.37□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 TOA2YKL058W 369 nt8.36□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 GND1YHR183W 1470 nt8.35□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 BRR1YPR057W 1026 nt8.35□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 CAB5YDR196C 726 nt8.34□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 APT2YDR441C 546 nt8.34□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 YPL251WYPL251W 303 nt8.34□□□□□ -1.07
NIP7Q08962 SHY1YGR112W 1170 nt8.33□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 LEU9YOR108W 1815 nt8.33□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 MEP3YPR138C 1470 nt8.32□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 LOT5YKL183W 921 nt8.32□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 FCY21YER060W 1587 nt8.31□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 MCH5YOR306C 1566 nt8.3□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 UGA4YDL210W 1716 nt8.29□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 YMR103CYMR103C 363 nt8.29□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 SMM1YNR015W 1155 nt8.29□□□□□ -1.08
NIP7Q08962 GND2YGR256W 1479 nt8.27□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 SAM2YDR502C 1155 nt8.27□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 YPI1YFR003C 468 nt8.27□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.27□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 URA6YKL024C 615 nt8.27□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 PRY1YJL079C 900 nt8.25□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 UFO1YML088W 2007 nt8.24□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.23□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 OYE3YPL171C 1203 nt8.23□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 YJL067WYJL067W 351 nt8.22□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 PET8YNL003C 855 nt8.22□□□□□ -1.09
NIP7Q08962 SSN3YPL042C 1668 nt8.21□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 NUC1YJL208C 990 nt8.19□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 SEC61YLR378C 1443 nt8.19□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 INA1YLR413W 2028 nt8.19□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 VRG4YGL225W 1014 nt8.18□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 LSB5YCL034W 1065 nt8.18□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 ADH1YOL086C 1047 nt8.17□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 CWC15YDR163W 528 nt8.16□□□□□ -1.1
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