Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HgfQ08048 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HgfQ08048 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HgfQ08048 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HgfQ08048 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HgfQ08048 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HgfQ08048 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HgfQ08048 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HgfQ08048 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HgfQ08048 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HgfQ08048 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HgfQ08048 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgfQ08048 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HgfQ08048 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgfQ08048 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HgfQ08048 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HgfQ08048 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms