Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL20P78556 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL20P78556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL20P78556 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL20P78556 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL20P78556 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL20P78556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL20P78556 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL20P78556 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL20P78556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL20P78556 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL20P78556 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL20P78556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL20P78556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL20P78556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL20P78556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL20P78556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL20P78556 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL20P78556 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL20P78556 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL20P78556 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL20P78556 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCL20P78556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL20P78556 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL20P78556 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms