Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc8a1P70414 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc8a1P70414 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc8a1P70414 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc8a1P70414 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a1P70414 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8a1P70414 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc8a1P70414 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8a1P70414 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms