Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sesn1P58006 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sesn1P58006 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sesn1P58006 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sesn1P58006 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sesn1P58006 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sesn1P58006 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sesn1P58006 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sesn1P58006 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms