Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YSR3YKR053C 1215 nt10.8□□□□□ -0.68
SHQ1P40486 YDR010CYDR010C 333 nt10.79□□□□□ -0.68
SHQ1P40486 UTR1YJR049C 1593 nt10.77□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 PRO1YDR300C 1287 nt10.76□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 YCR087WYCR087W 516 nt10.75□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 GAP1YKR039W 1809 nt10.74□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 LSC2YGR244C 1284 nt10.74□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 HIF1YLL022C 1158 nt10.74□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 SFA1YDL168W 1161 nt10.73□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 POM34YLR018C 900 nt10.73□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 RET2YFR051C 1641 nt10.72□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 YAT1YAR035W 2064 nt10.71□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 GLR1YPL091W 1452 nt10.71□□□□□ -0.69
SHQ1P40486 ALD4YOR374W 1560 nt10.7□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.7□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 XYL2YLR070C 1071 nt10.69□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 YMR244WYMR244W 1068 nt10.69□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 PHO89YBR296C 1725 nt10.69□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 NDI1YML120C 1542 nt10.68□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 ATG15YCR068W 1563 nt10.67□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 TOM6YOR045W 186 nt10.66□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 RBG1YAL036C 1110 nt10.65□□□□□ -0.7
SHQ1P40486 AIM45YPR004C 1035 nt10.63□□□□□ -0.71
SHQ1P40486 MRP20YDR405W 792 nt10.62□□□□□ -0.71
SHQ1P40486 YML089CYML089C 369 nt10.61□□□□□ -0.71
SHQ1P40486 SAM35YHR083W 990 nt10.58□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 PEX2YJL210W 816 nt10.57□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 DIF1YLR437C 402 nt10.57□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 COQ2YNR041C 1119 nt10.56□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 CMP2YML057W 1815 nt10.54□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 TIF6YPR016C 738 nt10.54□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 RBG2YGR173W 1107 nt10.53□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 YMR226CYMR226C 804 nt10.53□□□□□ -0.72
SHQ1P40486 HIP1YGR191W 1812 nt10.51□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 RPL4BYDR012W 1089 nt10.48□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 CLB6YGR109C 1143 nt10.48□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 RPL4AYBR031W 1089 nt10.48□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 DBP1YPL119C 1854 nt10.48□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 RPC82YPR190C 1965 nt10.48□□□□□ -0.73
SHQ1P40486 ZRT3YKL175W 1512 nt10.46□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 HXT1YHR094C 1713 nt10.45□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 INA1YLR413W 2028 nt10.44□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.42□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.42□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.42□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.42□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.42□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 MET28YIR017C 564 nt10.41□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YJL067WYJL067W 351 nt10.41□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YLR111WYLR111W 333 nt10.41□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 YAR028WYAR028W 705 nt10.41□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 SPT20YOL148C 1815 nt10.41□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 UTH1YKR042W 1098 nt10.4□□□□□ -0.74
SHQ1P40486 SHY1YGR112W 1170 nt10.39□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 NRT1YOR071C 1797 nt10.39□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 YBL086CYBL086C 1401 nt10.38□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 MTG2YHR168W 1557 nt10.38□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.38□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.38□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 LIP1YMR298W 453 nt10.37□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 RPS14BYJL191W 417 nt10.36□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 SDH5YOL071W 489 nt10.36□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 ZTA1YBR046C 1005 nt10.36□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 SED1YDR077W 1017 nt10.35□□□□□ -0.75
SHQ1P40486 AKR2YOR034C 2250 nt10.33□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 RAD23YEL037C 1197 nt10.32□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 HSL7YBR133C 2484 nt10.31□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 TSC10YBR265W 963 nt10.3□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 YPL251WYPL251W 303 nt10.28□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 ALP1YNL270C 1722 nt10.27□□□□□ -0.76
SHQ1P40486 SAM1YLR180W 1149 nt10.26□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 FIT3YOR383C 615 nt10.26□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 UFO1YML088W 2007 nt10.26□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 LEU9YOR108W 1815 nt10.26□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 TOA2YKL058W 369 nt10.24□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 BRR1YPR057W 1026 nt10.24□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 URA6YKL024C 615 nt10.23□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 YGR012WYGR012W 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
SHQ1P40486 GND2YGR256W 1479 nt10.19□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 RIB3YDR487C 627 nt10.18□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 YOR325WYOR325W 474 nt10.18□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 YMR103CYMR103C 363 nt10.17□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 OYE3YPL171C 1203 nt10.17□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 YLR279WYLR279W 390 nt10.16□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.16□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 MEP3YPR138C 1470 nt10.16□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 RPM1RPM1 483 nt10.15□□□□□ -0.78
SHQ1P40486 CWC15YDR163W 528 nt10.14□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.14□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 HOL1YNR055C 1761 nt10.14□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 MUP1YGR055W 1725 nt10.13□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 MSB4YOL112W 1479 nt10.13□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.13□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 YNL024CYNL024C 741 nt10.13□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 ILV3YJR016C 1758 nt10.13□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 PET8YNL003C 855 nt10.12□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 UGA4YDL210W 1716 nt10.12□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.11□□□□□ -0.79
SHQ1P40486 FLR1YBR008C 1647 nt10.06□□□□□ -0.8
SHQ1P40486 FMS1YMR020W 1527 nt10.06□□□□□ -0.8
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