Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfc1P35601 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfc1P35601 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfc1P35601 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfc1P35601 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfc1P35601 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfc1P35601 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfc1P35601 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfc1P35601 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfc1P35601 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfc1P35601 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfc1P35601 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfc1P35601 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rfc1P35601 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfc1P35601 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms