Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcr2P35343 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcr2P35343 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcr2P35343 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcr2P35343 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cxcr2P35343 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcr2P35343 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcr2P35343 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcr2P35343 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcr2P35343 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms