Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF8P32971 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFSF8P32971 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF8P32971 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF8P32971 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFSF8P32971 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF8P32971 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF8P32971 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFSF8P32971 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF8P32971 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF8P32971 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms