Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 POM34YLR018C 900 nt10.11□□□□□ -0.79
NDI1P32340 YML089CYML089C 369 nt10.11□□□□□ -0.79
NDI1P32340 PLB1YMR008C 1995 nt10.1□□□□□ -0.79
NDI1P32340 XYL2YLR070C 1071 nt10.1□□□□□ -0.79
NDI1P32340 MRP20YDR405W 792 nt10.09□□□□□ -0.79
NDI1P32340 PRO1YDR300C 1287 nt10.08□□□□□ -0.8
NDI1P32340 COQ2YNR041C 1119 nt10.08□□□□□ -0.8
NDI1P32340 AIM45YPR004C 1035 nt10.07□□□□□ -0.8
NDI1P32340 SNF1YDR477W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
NDI1P32340 GAP1YKR039W 1809 nt10.05□□□□□ -0.8
NDI1P32340 TOM6YOR045W 186 nt10.04□□□□□ -0.8
NDI1P32340 ATG15YCR068W 1563 nt10.04□□□□□ -0.8
NDI1P32340 RPL4BYDR012W 1089 nt10□□□□□ -0.81
NDI1P32340 RPL4AYBR031W 1089 nt10□□□□□ -0.81
NDI1P32340 CLB6YGR109C 1143 nt9.99□□□□□ -0.81
NDI1P32340 HIP1YGR191W 1812 nt9.98□□□□□ -0.81
NDI1P32340 RBG1YAL036C 1110 nt9.98□□□□□ -0.81
NDI1P32340 BIO5YNR056C 1686 nt9.98□□□□□ -0.81
NDI1P32340 NAR1YNL240C 1476 nt9.98□□□□□ -0.81
NDI1P32340 PEX2YJL210W 816 nt9.97□□□□□ -0.81
NDI1P32340 UTH1YKR042W 1098 nt9.97□□□□□ -0.81
NDI1P32340 TIF6YPR016C 738 nt9.96□□□□□ -0.82
NDI1P32340 NDI1YML120C 1542 nt9.96□□□□□ -0.82
NDI1P32340 UTR1YJR049C 1593 nt9.96□□□□□ -0.82
NDI1P32340 MET28YIR017C 564 nt9.94□□□□□ -0.82
NDI1P32340 PBP1YGR178C 2169 nt9.93□□□□□ -0.82
NDI1P32340 SAM35YHR083W 990 nt9.93□□□□□ -0.82
NDI1P32340 RPS14BYJL191W 417 nt9.92□□□□□ -0.82
NDI1P32340 SBA1YKL117W 651 nt9.91□□□□□ -0.82
NDI1P32340 NRT1YOR071C 1797 nt9.91□□□□□ -0.82
NDI1P32340 PRM5YIL117C 957 nt9.9□□□□□ -0.82
NDI1P32340 DIF1YLR437C 402 nt9.9□□□□□ -0.82
NDI1P32340 GLR1YPL091W 1452 nt9.86□□□□□ -0.83
NDI1P32340 ALD4YOR374W 1560 nt9.86□□□□□ -0.83
NDI1P32340 FIT3YOR383C 615 nt9.86□□□□□ -0.83
NDI1P32340 YAR028WYAR028W 705 nt9.84□□□□□ -0.83
NDI1P32340 CYT2YKL087C 675 nt9.82□□□□□ -0.84
NDI1P32340 RPM1RPM1 483 nt9.82□□□□□ -0.84
NDI1P32340 TSC10YBR265W 963 nt9.81□□□□□ -0.84
NDI1P32340 HIF1YLL022C 1158 nt9.8□□□□□ -0.84
NDI1P32340 YMR244WYMR244W 1068 nt9.79□□□□□ -0.84
NDI1P32340 SDH5YOL071W 489 nt9.77□□□□□ -0.85
NDI1P32340 ALP1YNL270C 1722 nt9.76□□□□□ -0.85
NDI1P32340 MTG2YHR168W 1557 nt9.75□□□□□ -0.85
NDI1P32340 SED1YDR077W 1017 nt9.73□□□□□ -0.85
NDI1P32340 RAD23YEL037C 1197 nt9.73□□□□□ -0.85
NDI1P32340 YMR226CYMR226C 804 nt9.73□□□□□ -0.85
NDI1P32340 DBP1YPL119C 1854 nt9.72□□□□□ -0.85
NDI1P32340 AKR2YOR034C 2250 nt9.72□□□□□ -0.85
NDI1P32340 YGR012WYGR012W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
NDI1P32340 YLR279WYLR279W 390 nt9.72□□□□□ -0.85
NDI1P32340 YLR111WYLR111W 333 nt9.71□□□□□ -0.86
NDI1P32340 HXT1YHR094C 1713 nt9.7□□□□□ -0.86
NDI1P32340 ZTA1YBR046C 1005 nt9.69□□□□□ -0.86
NDI1P32340 LIP1YMR298W 453 nt9.68□□□□□ -0.86
NDI1P32340 ZRT3YKL175W 1512 nt9.65□□□□□ -0.86
NDI1P32340 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 MSB4YOL112W 1479 nt9.64□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YAT1YAR035W 2064 nt9.63□□□□□ -0.87
NDI1P32340 RBG2YGR173W 1107 nt9.63□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YBL086CYBL086C 1401 nt9.63□□□□□ -0.87
NDI1P32340 RIB3YDR487C 627 nt9.61□□□□□ -0.87
NDI1P32340 HSL7YBR133C 2484 nt9.61□□□□□ -0.87
NDI1P32340 SAM1YLR180W 1149 nt9.59□□□□□ -0.87
NDI1P32340 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.59□□□□□ -0.87
NDI1P32340 LEU9YOR108W 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
NDI1P32340 SHY1YGR112W 1170 nt9.58□□□□□ -0.88
NDI1P32340 CMP2YML057W 1815 nt9.58□□□□□ -0.88
NDI1P32340 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.57□□□□□ -0.88
NDI1P32340 YPL251WYPL251W 303 nt9.56□□□□□ -0.88
NDI1P32340 APT2YDR441C 546 nt9.55□□□□□ -0.88
NDI1P32340 BRR1YPR057W 1026 nt9.55□□□□□ -0.88
NDI1P32340 FCY21YER060W 1587 nt9.54□□□□□ -0.88
NDI1P32340 CAB5YDR196C 726 nt9.53□□□□□ -0.88
NDI1P32340 TOA2YKL058W 369 nt9.53□□□□□ -0.88
NDI1P32340 URA6YKL024C 615 nt9.51□□□□□ -0.89
NDI1P32340 UFO1YML088W 2007 nt9.5□□□□□ -0.89
NDI1P32340 GND1YHR183W 1470 nt9.49□□□□□ -0.89
NDI1P32340 MEP3YPR138C 1470 nt9.49□□□□□ -0.89
NDI1P32340 UGA4YDL210W 1716 nt9.48□□□□□ -0.89
NDI1P32340 YJL067WYJL067W 351 nt9.48□□□□□ -0.89
NDI1P32340 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.47□□□□□ -0.89
NDI1P32340 YMR103CYMR103C 363 nt9.47□□□□□ -0.89
NDI1P32340 FRE6YLL051C 2139 nt9.46□□□□□ -0.9
NDI1P32340 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.46□□□□□ -0.9
NDI1P32340 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.46□□□□□ -0.9
NDI1P32340 LOT5YKL183W 921 nt9.44□□□□□ -0.9
NDI1P32340 OYE3YPL171C 1203 nt9.44□□□□□ -0.9
NDI1P32340 GND2YGR256W 1479 nt9.44□□□□□ -0.9
NDI1P32340 INA1YLR413W 2028 nt9.44□□□□□ -0.9
NDI1P32340 PET8YNL003C 855 nt9.43□□□□□ -0.9
NDI1P32340 SMM1YNR015W 1155 nt9.42□□□□□ -0.9
NDI1P32340 RPC82YPR190C 1965 nt9.41□□□□□ -0.9
NDI1P32340 YPI1YFR003C 468 nt9.4□□□□□ -0.9
NDI1P32340 PRY1YJL079C 900 nt9.4□□□□□ -0.9
NDI1P32340 SAM2YDR502C 1155 nt9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.1 ms