Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr4a1P12813 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr4a1P12813 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr4a1P12813 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr4a1P12813 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr4a1P12813 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr4a1P12813 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms