Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR1AP08908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTR1AP08908 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1AP08908 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1AP08908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1AP08908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1AP08908 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTR1AP08908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTR1AP08908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms