Protein–RNA interactions for Protein: P01108

Myc, Myc proto-oncogene protein, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycP01108 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MycP01108 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MycP01108 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MycP01108 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MycP01108 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MycP01108 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MycP01108 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MycP01108 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MycP01108 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MycP01108 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MycP01108 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MycP01108 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MycP01108 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MycP01108 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MycP01108 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MycP01108 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MycP01108 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MycP01108 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MycP01108 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MycP01108 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MycP01108 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MycP01108 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MycP01108 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MycP01108 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MycP01108 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MycP01108 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MycP01108 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MycP01108 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MycP01108 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MycP01108 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MycP01108 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MycP01108 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MycP01108 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MycP01108 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MycP01108 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MycP01108 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MycP01108 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MycP01108 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MycP01108 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MycP01108 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MycP01108 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MycP01108 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MycP01108 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MycP01108 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MycP01108 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MycP01108 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MycP01108 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MycP01108 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MycP01108 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MycP01108 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MycP01108 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycP01108 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycP01108 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MycP01108 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MycP01108 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MycP01108 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MycP01108 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MycP01108 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MycP01108 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MycP01108 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MycP01108 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MycP01108 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MycP01108 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MycP01108 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycP01108 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycP01108 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MycP01108 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MycP01108 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MycP01108 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MycP01108 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MycP01108 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycP01108 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MycP01108 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycP01108 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycP01108 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycP01108 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycP01108 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycP01108 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycP01108 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycP01108 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycP01108 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycP01108 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MycP01108 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycP01108 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MycP01108 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MycP01108 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MycP01108 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MycP01108 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MycP01108 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MycP01108 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MycP01108 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MycP01108 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MycP01108 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MycP01108 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MycP01108 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MycP01108 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MycP01108 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MycP01108 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MycP01108 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MycP01108 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms