Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNKO75909 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNKO75909 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNKO75909 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNKO75909 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNKO75909 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNKO75909 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNKO75909 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNKO75909 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNKO75909 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNKO75909 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNKO75909 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNKO75909 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNKO75909 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNKO75909 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNKO75909 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNKO75909 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNKO75909 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNKO75909 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNKO75909 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNKO75909 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNKO75909 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNKO75909 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNKO75909 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNKO75909 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNKO75909 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNKO75909 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNKO75909 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNKO75909 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNKO75909 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNKO75909 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNKO75909 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNKO75909 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNKO75909 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNKO75909 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNKO75909 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNKO75909 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNKO75909 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNKO75909 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNKO75909 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNKO75909 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNKO75909 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNKO75909 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNKO75909 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNKO75909 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNKO75909 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNKO75909 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNKO75909 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNKO75909 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNKO75909 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNKO75909 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNKO75909 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNKO75909 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNKO75909 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNKO75909 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNKO75909 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNKO75909 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNKO75909 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNKO75909 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNKO75909 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNKO75909 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNKO75909 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNKO75909 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNKO75909 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNKO75909 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNKO75909 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNKO75909 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNKO75909 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNKO75909 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNKO75909 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNKO75909 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNKO75909 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNKO75909 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNKO75909 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNKO75909 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNKO75909 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNKO75909 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNKO75909 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNKO75909 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNKO75909 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNKO75909 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNKO75909 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNKO75909 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNKO75909 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNKO75909 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNKO75909 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNKO75909 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNKO75909 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms