Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Kif1cO35071 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif1cO35071 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif1cO35071 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif1cO35071 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif1cO35071 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif1cO35071 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif1cO35071 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kif1cO35071 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kif1cO35071 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms