Protein–RNA interactions for Protein: O15226

NKRF, NF-kappa-B-repressing factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRFO15226 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 28
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NKRFO15226 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 28
NKRFO15226 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 28
NKRFO15226 PTDSS2-210ENST00000530087 596 ntTSL 211.45□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 28
NKRFO15226 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 28
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NKRFO15226 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.748e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-229ENST00000637208 8283 ntTSL 55.9□□□□□ -1.468e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-226ENST00000636635 122 ntTSL 55.36□□□□□ -1.558e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.638e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.688e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.698e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.728e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.818e-8■■■■■ 27.5
NKRFO15226 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.645e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.75■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -05e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 TLK1-208ENST00000466220 346 ntTSL 412.03□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.925e-8■■■■■ 27.2
NKRFO15226 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 519.62■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 27.1
NKRFO15226 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 417.74■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 27.1
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NKRFO15226 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 27.1
NKRFO15226 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 27.1
NKRFO15226 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 513.35□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 27.1
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NKRFO15226 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 27.1
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NKRFO15226 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 27.1
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NKRFO15226 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 27.1
NKRFO15226 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 27.1
NKRFO15226 TTC38-205ENST00000451998 582 ntTSL 218.27■□□□□ 0.526e-12■■■■■ 27
NKRFO15226 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-12■■■■■ 27
NKRFO15226 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.395e-7■■■■■ 27
NKRFO15226 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.145e-7■■■■■ 27
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NKRFO15226 TEN1-CDK3-201ENST00000567351 3897 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 26.9
NKRFO15226 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.074e-9■■■■■ 26.9
NKRFO15226 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.84e-9■■■■■ 26.9
NKRFO15226 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.34e-9■■■■■ 26.9
NKRFO15226 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 26.9
NKRFO15226 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.094e-9■■■■■ 26.9
NKRFO15226 AC068888.1-204ENST00000550601 711 ntTSL 316.13■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 26.7
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NKRFO15226 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 26.4
NKRFO15226 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 517.74■□□□□ 0.439e-8■■■■□ 26.4
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NKRFO15226 MCU-211ENST00000605597 3224 ntTSL 214.3□□□□□ -0.129e-8■■■■□ 26.4
NKRFO15226 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.583e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.323e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 322.14■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 319.91■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 319.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 AL603832.3-205ENST00000606954 680 ntTSL 217.47■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 317.4■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-215ENST00000484054 521 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 515.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 514.22□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 214.06□□□□□ -0.163e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.12□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 26.3
NKRFO15226 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 26.3
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