Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

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Length 1,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.82□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.82□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 YLR279WYLR279W 390 nt12.81□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 BOR1YNL275W 1731 nt12.79□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 NBP35YGL091C 987 nt12.78□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 PAU15YIR041W 375 nt12.78□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 FUN14YAL008W 597 nt12.78□□□□□ -0.36
YRF1-4O13559 YCL074WYCL074W 927 nt12.77□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 HSP60YLR259C 1719 nt12.76□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 CLB6YGR109C 1143 nt12.76□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 STR3YGL184C 1398 nt12.75□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 TOM6YOR045W 186 nt12.75□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 YGR012WYGR012W 1182 nt12.73□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 PEX2YJL210W 816 nt12.73□□□□□ -0.37
YRF1-4O13559 TIR3YIL011W 810 nt12.7□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 UTH1YKR042W 1098 nt12.7□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 RIB3YDR487C 627 nt12.69□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 YJL195CYJL195C 702 nt12.69□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 TSC10YBR265W 963 nt12.69□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 PRO1YDR300C 1287 nt12.65□□□□□ -0.38
YRF1-4O13559 BMT6YLR063W 1098 nt12.63□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 POM34YLR018C 900 nt12.62□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 HIP1YGR191W 1812 nt12.62□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 ADH1YOL086C 1047 nt12.61□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 PRP4YPR178W 1398 nt12.61□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 YKR005CYKR005C 1578 nt12.6□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 NRT1YOR071C 1797 nt12.59□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 ATG15YCR068W 1563 nt12.59□□□□□ -0.39
YRF1-4O13559 GPN2YOR262W 1044 nt12.58□□□□□ -0.4
YRF1-4O13559 Q0182Q0182 405 nt12.57□□□□□ -0.4
YRF1-4O13559 YGR259CYGR259C 441 nt12.56□□□□□ -0.4
YRF1-4O13559 ESS1YJR017C 513 nt12.55□□□□□ -0.4
YRF1-4O13559 MSB4YOL112W 1479 nt12.54□□□□□ -0.4
YRF1-4O13559 TIF6YPR016C 738 nt12.52□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 YEL008WYEL008W 381 nt12.51□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 YML089CYML089C 369 nt12.51□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 DPS1YLL018C 1674 nt12.5□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 CPD1YGR247W 720 nt12.5□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.5□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 RTN2YDL204W 1182 nt12.48□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 YPI1YFR003C 468 nt12.48□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 PLB1YMR008C 1995 nt12.46□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 MET28YIR017C 564 nt12.46□□□□□ -0.41
YRF1-4O13559 NVJ2YPR091C 2313 nt12.46□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 LSC2YGR244C 1284 nt12.45□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 ARP6YLR085C 1317 nt12.44□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 GAP1YKR039W 1809 nt12.43□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 LOT5YKL183W 921 nt12.42□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 AAC1YMR056C 930 nt12.41□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 PUP1YOR157C 786 nt12.4□□□□□ -0.42
YRF1-4O13559 ZTA1YBR046C 1005 nt12.38□□□□□ -0.43
YRF1-4O13559 FIT3YOR383C 615 nt12.37□□□□□ -0.43
YRF1-4O13559 GND1YHR183W 1470 nt12.37□□□□□ -0.43
YRF1-4O13559 SEN2YLR105C 1134 nt12.35□□□□□ -0.43
YRF1-4O13559 NAP1YKR048C 1254 nt12.34□□□□□ -0.43
YRF1-4O13559 UTR1YJR049C 1593 nt12.32□□□□□ -0.44
YRF1-4O13559 AKR2YOR034C 2250 nt12.29□□□□□ -0.44
YRF1-4O13559 DIF1YLR437C 402 nt12.29□□□□□ -0.44
YRF1-4O13559 SNF1YDR477W 1902 nt12.28□□□□□ -0.44
YRF1-4O13559 APT2YDR441C 546 nt12.27□□□□□ -0.45
YRF1-4O13559 PRM5YIL117C 957 nt12.24□□□□□ -0.45
YRF1-4O13559 IRC24YIR036C 792 nt12.24□□□□□ -0.45
YRF1-4O13559 PGC1YPL206C 966 nt12.23□□□□□ -0.45
YRF1-4O13559 YAR028WYAR028W 705 nt12.22□□□□□ -0.45
YRF1-4O13559 YBR232CYBR232C 360 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 MTG2YHR168W 1557 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 RIB2YOL066C 1776 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 SMM1YNR015W 1155 nt12.18□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 BIO5YNR056C 1686 nt12.17□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.17□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.15□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.15□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.15□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.15□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.15□□□□□ -0.46
YRF1-4O13559 PAU5YFL020C 369 nt12.14□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 ALP1YNL270C 1722 nt12.12□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 ALG12YNR030W 1656 nt12.12□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 YJL064WYJL064W 396 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 YJR114WYJR114W 393 nt12.11□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 SAM35YHR083W 990 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 FCY21YER060W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 UGA4YDL210W 1716 nt12.09□□□□□ -0.47
YRF1-4O13559 PAU19YMR325W 375 nt12.07□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 HXT12YIL170W 1374 nt12.06□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 ALD4YOR374W 1560 nt12.06□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 SED1YDR077W 1017 nt12.05□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 NAR1YNL240C 1476 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 STP3YLR375W 1032 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 PRY1YJL079C 900 nt12.03□□□□□ -0.48
YRF1-4O13559 TIM44YIL022W 1296 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 SLG1YOR008C 1137 nt12.01□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 YPL251WYPL251W 303 nt11.99□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 YJL055WYJL055W 738 nt11.98□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 LIP1YMR298W 453 nt11.97□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 HIF1YLL022C 1158 nt11.96□□□□□ -0.49
YRF1-4O13559 VRG4YGL225W 1014 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-4O13559 MCH5YOR306C 1566 nt11.94□□□□□ -0.5
YRF1-4O13559 YBL086CYBL086C 1401 nt11.94□□□□□ -0.5
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