Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc74aE9Q9U8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms