Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCT8L1PA6NM43 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT8L1PA6NM43 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCT8L1PA6NM43 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCT8L1PA6NM43 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCT8L1PA6NM43 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCT8L1PA6NM43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCT8L1PA6NM43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCT8L1PA6NM43 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms