Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll3A4Q9E5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll3A4Q9E5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll3A4Q9E5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttll3A4Q9E5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll3A4Q9E5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll3A4Q9E5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttll3A4Q9E5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll3A4Q9E5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttll3A4Q9E5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms