Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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