Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYV3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V9GYV3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYV3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYV3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYV3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GYV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms