Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMC3Q9Y6N6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
LAMC3Q9Y6N6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC3Q9Y6N6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms