Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDY1Q9Y6F8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDY1Q9Y6F8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms