Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHLDA3Q9Y5J5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHLDA3Q9Y5J5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms