Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB12Q9Y5F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB12Q9Y5F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms