Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAXBP1Q9Y5B6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms