Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NRXN3Q9Y4C0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NRXN3Q9Y4C0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms