Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms