Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBNO2Q9Y2G9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBNO2Q9Y2G9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBNO2Q9Y2G9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms