Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX2IPQ9Y2D8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX2IPQ9Y2D8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX2IPQ9Y2D8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms