Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms