Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHOC2Q9UQ13 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHOC2Q9UQ13 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms