Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGTPBP1Q9UPW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGTPBP1Q9UPW5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms