Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM35Q9UPQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms