Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FZD4Q9ULV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FZD4Q9ULV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms