Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRID1Q9ULK0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms