Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC13A4Q9UKG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms