Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF222Q9UK12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms