Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP25Q9UHP3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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