Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX20Q9UHI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX20Q9UHI6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms