Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM8A1Q9UBU6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM8A1Q9UBU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms