Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DKK3Q9UBP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms