Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPARGC1AQ9UBK2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms